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Description et illustration des principales espèces de moisissures de l'habitat



Nous proposons ici une synthèse des espèces les plus fréquentes rencontrées (isolées) dans les habitats européens, avec leurs principaux caractères morphologiques, écologiques et éventuellement les risques pathologiques.



Deutero-et Ascomycota


Les Aspergillus et Penicillium dont plusieurs espèces sont impliquées dans l’habitat, sont présentés sous forme de tableaux récapitulatifs des différents caractères spécifiques.

⇒ Acremonium strictum W. Gams
Acremonium strictum
  • Colonies rosées, muqueuses avec quelques mèches filamenteuses. Spores unicellulaires, cylindriques, hyalines, groupées en têtes à l’extrémité de cellules conidiogènes (phialides).
  • Températures de croissance optimale : 20-25°C
  • Habitat naturel : sol, végétaux, autres champignons.
  • Faible dispersion par l’air ce qui fait qu’on l’isole essentiellement sur les surfaces.
  • Parfois associé à des pathologies humaines.
  • Son implication en allergie reste à confirmer.


⇒ Alternaria alternata Fr. Keissler (= Alternaria tenuis Nees)
Alternaria alternata
  • Colonies vert foncé à noir, spores pluricellulaires en raquettes avec bec, disposées en chaînes ramifiées
  • Températures de croissance : Mini : 2-6°C, opti : 25-28°C, maxi : 31-32°C.
  • Habitat naturel : sur plantes, sol, textiles, cartons…
  • Essentiellement dans l’atmosphère de l’habitat et dans l’air extérieur en été.
  • Parfois associé à des infections cutanées.
  • Aéro-allergène reconnu.


⇒ Aureobasidium pullulans de Bary Arnaud
Aureobasidium pullulans
  • Colonies noires, luisantes, humides. Filaments noirs, épais, cloisonnés et fragmentés, spores unicellulaires, hyalines
  • Températures de croissance : Mini : 2-10°C, opti : 25°C, maxi : 35°C.
  • Habitat naturel : sur plantes et supports très humides en voie de dégradation
  • Se rencontre sur les surfaces et en faible quantité dans l’air.
  • Associée à divers phénomènes allergiques respiratoires liés à l’habitat.
Parfois mis en cause dans des infections liées à des blessures.

⇒ Botrytis cinerea Pers.
Botrytis cinerea
  • Colonies grises, d’aspect poussiéreux, spores hyalines, unicellulaires, formées de manière synchrone se détachant facilement
  • Températures de croissance : Mini : 5-12°C, opti : 22-25-°C, maxi : 33-35°C.
  • Habitat naturel : sur plantes en parasite et/ou saprophyte (pourriture grise ou « pourriture noble » sur les raisins).
  • Se rencontre dans l’air.
Cas d’allergie chez les ouvriers agricoles travaillant dans les serres ou les vignes.

⇒ Chaetomium globosum Kunze
Chaetomium globosum
  • Colonies assez rases vert foncé, avec des petites boules visibles à l’oeil nu qui sont les fructifications (périthèces contenant des asques). Spores brunes en forme de citron.
  • Températures de croissance : Mini : 4-10°C, opti : 18-24°C, maxi : 37°C.
  • Habitat naturel : Végétaux en décomposition et autres supports cellulosiques.
  • Dans l’habitat s’observe sur les surfaces des revêtements papier, des cartons, des livres.


⇒ Cladosporium cladosporioides Fres. de Vries
Cladosporium cladosporioides
  • Colonies vert foncé à noir, spores en chaînes ramifiées, avec une cicatrice à chaque extrémité.
  • Températures de croissance : Mini : 3-10°C, opti : 20-28°C.
  • Habitat naturel : plantes, air, sol, céréales, textiles.
  • Surtout détecté dans l’air.
Rôle allergisant de Cladosporium souvent comparé à celui d’Alternaria bien que de moindre importance.
Cladosporium herbarum est aussi fréquemment rencontré. Inféodé aux plantes, sa présence est plus saisonnière avec un maximum en été.

⇒ Epicoccum nigrum Link
Epicoccum nigrum
  • Colonies laineuses à développement rapide, de couleur jaune, brique à rouge foncé. Spores noires arrondies, pluriseptées, verruqueuses avec une cellule basale plus claire.
  • Températures de croissance : Mini : 3-4°C, opti : 23-28°C, maxi : 45°C.
  • Habitat naturel : Envahissseur secondaire de plantes mortes, sol, divers supports cellulosiques.
  • Responsable de rhinites allergiques estivales et d’asthme.


⇒ Fusarium solani (Mart.) Sacc.
  • Colonies claires, veloutées, blanches à violacées.
  • Conidies de deux types : unicellulaires (microconidies) ellipsoïdes, hyalines et pluricellulaires (macroconidies) arquées.
  • Présence de spores de repos : chlamydospores.
  • Températures de croissance : Mini : 3-10°C, opti : 27-31°C, maxi : 37°C
  • Habitat naturel : plantes, sol, eau, air.
  • Se rencontre dans l’air et sur les surfaces.
  • Peut entrainer des allergies respiratoires en particulier en milieu rural.
  • Cité dans quelques cas de kératites.
D’autres espèces : F.oxysporum et F.culmorum peuvent produire des mycotoxines (trichothécènes, zéaralenones).

⇒ Phoma glomerata (Corda) Wollenw. & Hochapfel
Phoma glomerata
  • Colonies grisâtres à noires, mycélium aérien peu abondant diffusant parfois un pigment rouge. Présence de petites boules noires (pycnides) contenant des conidies hyalines, unicellulaires.
  • Températures de croissance : Opti : 22-25°C, maxi : 35°C
  • Habitat naturel : débris végétaux, sol, substrats cellulosiques.
  • Se rencontre dans l’air et sur les surfaces.
  • Associé à des cas d’asthme domestique.


⇒ Stachybotrys chartarum (Ehrenb.) Hughes (= Stachybotrys atra Corda)
Stachybotrys chartarum
  • Colonies noires, poudreuses. Conidies foncées, allongées, rugueuses, groupées en tête au sommet de phialides en éventail.
  • Températures de croissance : Mini : 7°C, opti : 23°C, maxi : 37- 40°C
  • Habitat naturel : débris végétaux, supports cellulosiques très humides
  • Se rencontre sur les surfaces.
  • Métabolites toxiques : Satratoxines G et H, verrucarine, roridine
  • Décrit comme étant associé à des cas d’hémorragie pulmonaire aux Etats Unis et au Canada.


⇒ Trichoderma harzianum Rifai
Trichoderma harzianum
  • Colonies vertes, granuleuses. Conidies rondes lisses.
  • Températures de croissance : Opti : 15-30°C, maxi : 30-36°C
  • Habitat naturel : sol, supports cellulosiques, bois en décomposition
  • Métabolites toxiques : Gliotoxine
Trichoderma viride Pers., à conidies rugueuses se rencontre aussi dans l’habitat sur des supports ligneux.

⇒ Ulocladium botrytis Preuss
Ulocladium botrytis
  • Colonies poudreuses à laineuses, vert foncé à noir. Conidies solitaires, ovoides, brunes, verruqueuses, pluricellulaires. Ressemble à Alternaria dont il diffère par l’absence de bec et par ses conidies solitaires.
  • Habitat naturel : saprophyte commun fréquent dans les habitats humides sur les plâtres, poutres et revêtements muraux
  • Même type d’activité allergénique que Alternaria.
  • Autres espèces rencontrées dans l’habitat : U. atrum et U. chartarum.


⇒ Genre Aspergillus
Genre Aspergillus Le genre Aspergillus compte 250 espèces dont une dizaine se rencontrent dans l’habitat. Fumigatus et niger sont des aéroallergènes bien documentés. Versicolor, glaucus et nidulans sont aussi décrits.
Les espèces d’Aspergillus se différencient surtout par la couleur des colonies, l’organisation des têtes conidiennes, la forme et l’ornementation des conidies et l’éventuelle présence de reproduction sexuée.
Espèces Organisation des têtes Couleur des colonies Temp. opt. croissance Habitat naturel Métabolites toxiques
A. fumigatus unisériée Bleu-vert 35-40 °C Sol, compost, terre de pots de fleurs… Gliotoxine
A. niger bisériée Brun-noir 17- 42°C Sol, plantes, aliments, matériaux divers
A. versicolor bisériée Vert, jaune-orange 21-30°C Sol, aliments, matériaux divers Stérigmatocystine Géosmine
A. flavus Bi et/ou unisérié Vert jaune 25-42°C Sol, céréales Aflatoxines
A. nidulans (=Emericella nidulans) bisériée Vert foncé, revers rouge sombre 26-30°C Sol, compost, aliments
A.glaucus (= Eurotium herbariorum) unisériée Vert, granulations jaune doré 25-30°C Sol, aliments peu hydratés
Principales espèces d’Aspergillus rencontrées dans l’habitat et leurs caractères généraux.


⇒ Genre Penicillium
Genre Penicillium Le genre Penicillium compte environ 230 espèces dont une dizaine se rencontre dans l’habitat.
Penicillium aurantiogriseum, brevicompactum, chrysogenum, citrinum, glabrum présentent des risques d’allergie. P. commune, corylophilum, expansum, funiculosum, variabile sont aussi présents dans l’habitat.
Ce sont des contaminants fréquemment et régulièrement rencontrés dans l’air des habitations et à l’extérieur.
En général, les espèces se différencient surtout par la couleur des colonies et des pigments qu’elles sécrètent, l’organisation des structures conidiogènes, la taille et la forme des conidies et la vitesse de croissance en conditions standardisées.

Genre Penicillium
Schéma général de l’organisation des pinceaux de Penicillium, utilisée dans l’identification d’après Samson et coll
A : monoverticillé, B : terverticillé, C : biverticillé, D : groupement des pinceaux, E : forme des phialides


Les espèces les plus fréquentes dans l’habitat ont des caractères communs : température optimale de développement 22-25°C, couleur gris-bleu à bleu-vert, elles sont ubiquistes et se rencontrent fréquemment dans le sol et sur les aliments. Leur identification ne peut se faire que par la mise en culture et l’observation des caractères microscopiques des structures conidiogènes.

Zygomycota


Quelques espèces de Zygomycètes peuvent faire partie des moisissures rencontrées dans l’habitat. Chez ces champignons, dont la croissance est généralement rapide, les spores sont formées et contenues dans des enveloppes (sporanges) dont la paroi se rompt à maturité, libérant les spores et laissant voir, au microscope, une vésicule intérieure : la columelle, de forme caractéristique, parfois très réduite. Les colonies sont assez épaisses, gris foncé à gris clair ou blanc.

⇒ Absidia corymbifera
Absidia corymbifera
  • Spores globuleuses à ellipsoïdes, hyalines. Columelles piriformes.
  • Températures de croissance : Opti : 35-37°C, maxi : 45°C
  • Habitat naturel : sol, fourrage, végétaux et fruits en décomposition
  • Agent infectieux impliqué dans la maladie du poumon du fermier.


⇒ Mucor (circinelloides, hiemalis, racemosus) et Rhizopus spp
  • Columelles de formes plus ou moins globuleuses avec ou sans apophyses.
  • Températures de croissance : Mini : 5 et 25°C, opti : 20-25°C, maxi : 30 –37°C.
  • Habitat naturel : assez ubiquistes : sol, air, aliments divers…
  • Mucor circinelloides et Rh. microsporus peuvent avoir des implications pathologiques et M. racemosus est imliqué dans des cas d’allergie.

Basidiomycètes


Le principal Basidiomycète susceptible d’être rencontré dans l’habitat est la fâcheusement célèbre Mérule (Serpula lacrimans). Ce champignon colonise d’abord les bois humides à partir desquels le mycélium peut se propager très largement dans l’environnement sur de longues distances. Dans certaines conditions il fructifie (reproduction sexuée) et forme des spores (basidiospores) de couleur rouille dont l’inhalation peut entraîner l’asthme et même des alvéolites.


Conclusion


En conclusion, les particularités écologiques et pathogènes ou allergisantes de quelques espèces, relativement peu nombreuses à l’intérieur des genres, soulignent la nécessité d’une identification précise des espèces rencontrées de façon majoritaire, pour évaluer les risques réels dus à la présence de moisissures dans l’habitat.